Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT3P12035 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT3P12035 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT3P12035 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT3P12035 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT3P12035 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT3P12035 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT3P12035 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT3P12035 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms