Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ODC1P11926 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ODC1P11926 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ODC1P11926 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ODC1P11926 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ODC1P11926 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ODC1P11926 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms