Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COX5BP10606 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX5BP10606 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COX5BP10606 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX5BP10606 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
COX5BP10606 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms