Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG8P0DPA2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG8P0DPA2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG8P0DPA2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG8P0DPA2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG8P0DPA2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VSIG8P0DPA2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSIG8P0DPA2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms