Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
U2AF1L5P0DN76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
U2AF1L5P0DN76 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms