Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2MP0CAP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLR2MP0CAP2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLR2MP0CAP2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms