Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C4AP0C0L4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C4AP0C0L4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms