Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GLI1P08151 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GLI1P08151 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI1P08151 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI1P08151 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI1P08151 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI1P08151 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI1P08151 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms