Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGAVP06756 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGAVP06756 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms