Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLBP06746 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLBP06746 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLBP06746 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLBP06746 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLBP06746 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLBP06746 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLBP06746 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms