Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IFNA4P05014 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IFNA4P05014 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms