Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL2A1P02458 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL2A1P02458 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms