Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1RP00736 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1RP00736 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1RP00736 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1RP00736 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C1RP00736 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C1RP00736 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C1RP00736 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1RP00736 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C1RP00736 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1RP00736 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C1RP00736 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms