Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TTLL1O95922 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTLL1O95922 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL1O95922 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms