Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPAN13O95857 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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TSPAN13O95857 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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