Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BRD1O95696 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD1O95696 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD1O95696 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD1O95696 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD1O95696 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRD1O95696 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRD1O95696 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD1O95696 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRD1O95696 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD1O95696 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD1O95696 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD1O95696 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD1O95696 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD1O95696 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD1O95696 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRD1O95696 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD1O95696 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms