Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNTO95613 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNTO95613 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCNTO95613 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNTO95613 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNTO95613 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCNTO95613 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCNTO95613 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCNTO95613 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCNTO95613 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCNTO95613 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms