Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24BO95487 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24BO95487 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms