Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MBD4O95243 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MBD4O95243 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MBD4O95243 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MBD4O95243 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MBD4O95243 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MBD4O95243 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MBD4O95243 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MBD4O95243 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MBD4O95243 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms