Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPM3O75607 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPM3O75607 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPM3O75607 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPM3O75607 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NPM3O75607 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPM3O75607 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPM3O75607 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms