Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPFIA4O75335 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms