Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PRAMEF10O60809 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PRAMEF10O60809 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PRAMEF10O60809 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PRAMEF10O60809 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PRAMEF10O60809 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PRAMEF10O60809 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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