Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN3BO60391 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN3BO60391 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN3BO60391 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms