Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP104O60308 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEP104O60308 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CEP104O60308 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP104O60308 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CEP104O60308 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CEP104O60308 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CEP104O60308 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CEP104O60308 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP104O60308 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP104O60308 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP104O60308 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP104O60308 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP104O60308 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms