Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RRP9O43818 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RRP9O43818 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RRP9O43818 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRP9O43818 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRP9O43818 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms