Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRNO43815 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRNO43815 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRNO43815 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRNO43815 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRNO43815 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRNO43815 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRNO43815 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRNO43815 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRNO43815 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRNO43815 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STRNO43815 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STRNO43815 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STRNO43815 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms