Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSNA1O43805 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms