Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYNGR2O43760 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYNGR2O43760 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms