Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKAB2O43741 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB2O43741 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms