Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COCHO43405 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COCHO43405 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COCHO43405 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COCHO43405 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
COCHO43405 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COCHO43405 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COCHO43405 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COCHO43405 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COCHO43405 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COCHO43405 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COCHO43405 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms