Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MTSS1O43312 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTSS1O43312 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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