Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHOX2AO14813 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHOX2AO14813 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms