Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
J3QQQ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
J3QQQ9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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