Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms