Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DXG7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DXG7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DXG7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DXG7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DXG7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DXG7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DXG7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DXG7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DXG7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4DXG7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4DXG7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4DXG7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4DXG7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms