Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC85CA6NKD9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC85CA6NKD9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms