Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6CA6NDK9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6CA6NDK9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms