Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB19A4D1S5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB19A4D1S5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms