Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE3A1L190 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE3A1L190 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms