Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC61Q9Y6R9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC61Q9Y6R9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms