Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP16Q9Y5T5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP16Q9Y5T5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP16Q9Y5T5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms