Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRP12Q9Y561 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRP12Q9Y561 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms