Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP15Q9Y4E8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP15Q9Y4E8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP15Q9Y4E8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms