Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y467

SALL2, Sal-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL2Q9Y467 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL2Q9Y467 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL2Q9Y467 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL2Q9Y467 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms