Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KNSTRNQ9Y448 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KNSTRNQ9Y448 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KNSTRNQ9Y448 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms