Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REXO2Q9Y3B8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms