Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIT1Q9Y2X7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIT1Q9Y2X7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIT1Q9Y2X7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIT1Q9Y2X7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIT1Q9Y2X7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIT1Q9Y2X7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GIT1Q9Y2X7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIT1Q9Y2X7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms