Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHDC2Q9Y2U9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms