Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP20Q9Y2K6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP20Q9Y2K6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms