Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SBNO2Q9Y2G9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SBNO2Q9Y2G9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms